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Lyon

    Ingénieur d'étude en bioinformatique - Lyon, France - CNRS

    CNRS
    CNRS Lyon, France

    il y a 2 semaines

    Cnrs background
    CDD
    Description

    Informations générales

    Intitulé de l'offre : Ingénieur d'étude en bioinformatique (H/F)
    Référence : UMR5261-HELPUC-010
    Nombre de Postes : 1
    Lieu de travail : LYON 08
    Date de publication : mardi 7 mai 2024
    Type de contrat : CDD Technique/Administratif
    Durée du contrat : 13 mois
    Date d'embauche prévue : 1 juillet 2024
    Quotité de travail : Temps complet
    Rémunération : A partir de 2304 euros bruts mensuel selon expérience.
    Niveau d'études souhaité : Niveau 6 - (Bac+3 ou 4)
    Expérience souhaitée : 1 à 4 années
    BAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
    Emploi type : Ingénieur-e biologiste en traitement de données

    Missions

    Nous recherchons ingé en bioinformatique très motivé.e et cré pour rejoindre l'équipe « Mécanismes fondamentaux et pathophysiologiques impliqués dans les ataxies » à l'Institut Neuromyogène - Laboratoire Physiopathologie et Génétique du Neurone et du Muscle, France. L'agent fera partie d'une équipe de recherche qui se concentre sur les mécanismes impliqués dans les ataxies héréditaires à partir de modèles animaux ou cellulaires. L'agent aura pour mission de développer des méthodes bioinformatiques et statistiques pour analyser, interpréter et intégrer les données omiques à haut débit générées (scRNA-seq, snRNA-seq, spatial transcriptomics, protéomique). L'agent travaillera avec divers membres de l'équipe.

    Activités

    Analyser et interpréter les résultats omics (scRNA-seq, snRNA-seq, spatial transcriptomics protéomique) de façon autonome
    - Présenter ses résultats au reste de l'équipe lors de réunions
    - Etre force de proposition dans le contexte de ses missions

    Compétences

    Obligatoire :
    Solides compétences en codage à l'aide de R ou python et connaisance de bases dans les deux languages
    Expérience approfondie de l'analyse de données de séquençage transcriptomique
    Expérience dans le développement d'algorithmes ou de pipelines de séquençage transcriptomique (alignement, analyse de l'expression différentielle, etc...)
    Niveau B2 en anglais requis
    Préférable :
    Expérience dans l'analyse de données de séquençage de cellules uniques
    Expérience en analyse de données obtenues avec la technologie 10X Genomics
    Expérience avec git et les lignes de commande basées sur Unix/Linux
    Expérience préalable en termes d'extraction d'informations biologiques à partir de données NGS et des principales bases de données bioinformatiques
    Expérience préalable de la mise en œuvre de bases de données et/ou de la création de logiciels (. shiny apps)
    Connaissances / compétences en analyse biostatistique
    Intérêt pour les neurosciences

    Contexte de travail

    L'activité s'exercera au sein de l'UMR5261, qui se situe à la faculté de Médecine et de Pharmacie Rockefeller. L'Institut NeuroMyoGène est dédié à l'étude de la physiopathologie du muscle et du système nerveux, avec une ouverture vers la recherche clinique et translationnelle. Avec 12 équipes de recherche soit environ 150 personnes, la plus forte concentration en France d'équipes se focalisant sur les maladies neuromusculaires, les objectifs de notre unité sont d'élucider des aspects fondamentaux de la biologie du muscle et du système nerveux, depuis le développement embryonnaire jusqu'au vieillissement. Nos équipes de recherche déploient des méthodes d'approche multidisciplinaire allant du gène aux fonctions physiologiques.

  • CNRS

    H/F Ingénieur d'études en bioinformatique, analyse de données génomiques

    il y a 1 jour

    CNRS Lyon, France CDD

    Informations générales · Intitulé de l'offre : H/F Ingénieur d'études en bioinformatique, analyse de données génomiques · Référence : UMR5667-JULPRA-009 · Nombre de Postes : 1 · Lieu de travail : LYON 07 · Date de publication : mercredi 15 mai 2024 · Type de contrat : CDD Techn ...

  • CNRS

    Bioinformaticien Pour Le Développement

    il y a 1 semaine

    CNRS Lyon, France

    Date Limite Candidature : lundi 4 septembre 2023 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Bioinformaticien pour le développement d'environnements d'analyse de données génomiques et métagénomiques (H/F)** · Référence : UAR3601-GUYPER-002 · Nombre de Postes : 1 · Li ...

  • CNRS

    Décoder Les Règles de La Régulation Du Programme

    il y a 1 semaine

    CNRS Lyon e, France

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: · - Français · - Anglais · Date Limite Candidature : dimanche 9 juin 2024 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Décoder les règles de la régulation du programme de réplication de l'ADN (H/F)** · Référence : ...

  • CNRS

    Chercheur Post Doctorant

    il y a 2 semaines

    CNRS Lyon e, France

    Date Limite Candidature : vendredi 17 février 2023 · **Informations générales**: · Référence : UMR5239-ISASER-021 · Nombre de Postes : 1 · Lieu de travail : LYON 07 · Date de publication : vendredi 27 janvier 2023 · Type de contrat : CDD Scientifique · Durée du contrat : 24 mois ...

  • Hospices Civils de Lyon - HCL

    Data Manager

    il y a 2 semaines

    Hospices Civils de Lyon - HCL Lyon, France

    **Détails de l'offre**: · **POSTE PROPOSÉ** · Data Manager H/F - GCS Auragen · **DESCRIPTIF** · L'ÉTABLISSEMENT: · Les Hospices Civils de Lyon, ce sont 13 hôpitaux publics, tous animés par une triple mission : le soin, la recherche et l'enseignement. Nous formons ensemble une com ...

  • Hospice Civil de Lyon

    Data Manager

    il y a 2 semaines

    Hospice Civil de Lyon Lyon e, France

    **À propos de nous**: · Les Hospices Civils de Lyon, ce sont 13 hôpitaux publics, tous animés par une triple mission : le soin, la recherche et l'enseignement. Nous formons ensemble une communauté de femmes et hommes, soignants et non soignants, partageant une seule et même vocat ...

  • CNRS

    Postdoctorant en Génomique Environnementale

    il y a 2 semaines

    CNRS Villeurbanne, France

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: · - Français · - Anglais · Date Limite Candidature : lundi 10 avril 2023 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Postdoctorant en génomique environnementale (H/F)** · Référence : UMR5240-AUDMAR-004 · Nombre d ...

  • CNRS

    Post-doc (H/F) étude Du Microbiote Des Plantes

    il y a 2 semaines

    CNRS Villeurbanne, France

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: · - Français · - Anglais · Date Limite Candidature : mercredi 5 juin 2024 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Post-doc H/F étude du microbiote des plantes non-mycorhiziennes - M/F** · Référence : UMR5557- ...

  • CNRS

    Chercheur (H/F)

    il y a 2 semaines

    CNRS Villeurbanne, France

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: · - Français · - Anglais · Date Limite Candidature : mercredi 20 décembre 2023 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Chercheur (H/F) en écoimmunologie** · Référence : UMR5023-NATMON-001 · Nombre de Postes : ...

  • CNRS

    Chercheuse Postdoctorante ou Chercheur

    il y a 2 semaines

    CNRS Villeurbanne, France

    Date Limite Candidature : mercredi 15 février 2023 · **Informations générales**: · Référence : UMR5558-LAUJAC-005 · Nombre de Postes : 1 · Lieu de travail : VILLEURBANNE · Date de publication : mercredi 25 janvier 2023 · Type de contrat : CDD Scientifique · Durée du contrat : 18 ...

  • INRAE

    Stage en Chimie Analytique

    il y a 1 semaine

    INRAE Villeurbanne, France

    Theix Saint Genès Champanelle _ · **RETOUR À LA LISTE DES RÉSULTATS** · **Présentation INRAE**: · L'Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de perso ...

  • bioMérieux sa

    Cdi - Data Mangement Leader - (F/H)

    il y a 1 semaine

    bioMérieux sa Lyon, France

    Descriptif du poste · **Quelles seront vos responsabilités ?**Vous aurez le rôle de manager (environ 60 % de votre temps). Dans ce but: · - Vous serez responsable des processus de Data Management et dans ce but, de la bonne exécution des essais cliniques selon les réglementations ...

  • CNRS

    Post-doctorat (H/F)

    il y a 1 semaine

    CNRS Villeurbanne, France

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: · - Français · - Anglais · Date Limite Candidature : vendredi 1 décembre 2023 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Post-doctorat (H/F) sur la recherche d'associations génotype-phénotype à l'échelle phylogé ...

  • CNRS

    Chercheuse / Chercheur en Biologie Du Cancer (H/F)

    il y a 1 semaine

    CNRS Lyon e, France

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: · - Français · - Anglais · Date Limite Candidature : jeudi 10 août 2023 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Chercheuse / Chercheur en biologie du cancer (H/F)** · Référence : UMR5286-CELDEL-001 · Nombre d ...

  • CNRS

    Chercheuse / Chercheur en Biologie Du Cancer (H/F)

    il y a 2 jours

    CNRS Lyon e, France

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: · Date Limite Candidature : jeudi 10 août 2023 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Chercheuse / Chercheur en biologie du cancer (H/F)** · Référence : UMR5286-CELDEL-001 · Nombre de Postes : 1 · Lieu de tr ...

  • CNRS

    Chercheuse / Chercheur en Neurosciences Du Cancer

    il y a 1 semaine

    CNRS Lyon e, France

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: · - Français · - Anglais · Date Limite Candidature : jeudi 22 février 2024 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Chercheuse / Chercheur en Neurosciences du Cancer (H/F)** · Référence : UMR5286-CELDEL-002 · ...

  • CNRS

    Chercheur (H/F) Post-doctoral Sur La Résilience Du

    il y a 2 jours

    CNRS Villeurbanne, France

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: · Date Limite Candidature : jeudi 17 août 2023 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Chercheur (H/F) post-doctoral sur la résilience du microbiome du sol** · Référence : UMR5557-BEABIG-016 · Nombre de Poste ...

  • CNRS

    Chercheur en Génomique Des éléments Impliqués

    il y a 5 jours

    CNRS Villeurbanne, France

    Date Limite Candidature : lundi 30 janvier 2023 · **Informations générales**: · Référence : UMR5558-NATARB-053 · Nombre de Postes : 1 · Lieu de travail : VILLEURBANNE · Date de publication : lundi 9 janvier 2023 · Type de contrat : CDD Scientifique · Durée du contrat : 15 mois · ...

  • CNRS

    Chercheur (H/F)

    il y a 2 jours

    CNRS Villeurbanne, France

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: · - Français · - Anglais · Date Limite Candidature : jeudi 17 août 2023 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Chercheur (H/F) post-doctoral sur la résilience du microbiome du sol** · Référence : UMR5557-BEA ...

  • CNRS

    Post-doctorant (H/F)

    il y a 1 jour

    CNRS Villeurbanne, France

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: · - Français · - Anglais · Date Limite Candidature : vendredi 29 mars 2024 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Post-doctorant (H/F) en hydrologie urbaine et écophysiologie** · Référence : UMR5023-FREHER-0 ...