Ingénieur Bioinformatique Institut Pasteur MadagascarH/F - Paris, France - INSTITUT PASTEUR

Description

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A propos du poste :

L'Institut Pasteur de Madagascar (IPM) est un établissementscientifique privé à but non lucratif et reconnu d'utilité publiquequi a pour mission de contribuer à la prévention et au traitementdes maladies par des activités de recherche, de formation et desanté publique. A ce titre, l'Institut abrite plusieurs centres oulaboratoires nationaux de référence reconnus pour leurs compétencesen matière de diagnostic et de surveillance pour des maladiesinfectieuses d'intérêt local et régional (arboviroses, grippe,rage, poliomyélite, peste, tuberculose ...). Afin de développer ses activités en génomique, l'unité devirologie cherche à recruter un(e) ingénieur(e) de recherche enbioinformatique. Cette offre d'emploi vise à accroître la capacitéde l'unité à mieux suivre les virus endémiques et à répondre auxfutures épidémies virales. Les données génomiques étant générées àun rythme sans précédent, l'unité doit développer des outilsinformatiques permettant le suivi des pathogènes et de leurévolution ainsi que la caractérisation de nouveauxpathogènes/variants.Votre mission principale sera de développer et de maintenirdes outils informatiques capables : - d'identifier les agents pathogènes à partir de données deséquençage à haut débit ciblées et non ciblées, provenant destechnologies Illumina et Oxford Nanopore,- de suivre leur évolution (phylogénétique) et de surveillerl'émergence de mutations d'intérêt et d'événements évolutifsspécifiques. Vous devrez assurer le traitement des données générées enlien avec les biologistes de l'unité. Vous effectuer une veille dela littérature scientifique et évaluer les outils publiés afind'identifier et améliorer, si nécessaire, les outilsbioinformatiques pour aider à automatiser les workflows surdiverses tâches d'analyse de routine. Vous assurer la formation d'autres membres de l'unité et del'institut à l'utilisation des outils de bio-informatiquedéveloppés. Enfin, vous participez à la rédaction des articlesscientifiques et à des conférences.Le poste est à pourvoir à l'Institut Pasteur deMadagascar

Profil recherché :

Titulaire d'un doctorat ou d'un diplôme équivalent dans ledomaine de la bioinformatique, biologie computationnelle, vous aveza minima 3 ans d'expérience professionnelle dans un postesimilaire.Vous devez avoir une bonne connaissance des outilsbioinformatiques couramment utilisés dans le domaine de lagénomique et de l'analyse des données de séquençage de haut débit. Bonne maîtrise de la construction et de la maintenance depipelines d'analyse de données, ainsi qu'une connaissance desbonnes pratiques de gestion des données et du logiciel sontindispensables.Bonne connaissance des méthodes de bioinformatique évolutiveest requise. En particulier, l'analyse de séquences, l'alignementet la reconstruction phylogénétique. Vous devez être familier avec les méthodes bayésiennes (MrBayes, BEAST). Aptitudes personnelles : - être capable de travailler au sein d'une équipemultidisciplinaire,- être organisé(e), - rigoureux(se), - avoir le sens des responsabilités ainsi qu'une bonnecapacité de communication et d'excellentes qualités relationnelles.Vos conditions et environnement de travail- Politique de congés très favorable- Environnement multiculturel- Engagements RSE forts- Environnement de travail : Laboratoires de l'IPM dans unparc arboré de 9 ha- Politique dynamique d'investissements