Bourse Doctorale Marie Curie en Régénération - Lyon e, France - CNRS

CNRS

Entreprise vérifiée

Lyon e, France

il y a 8 heures

Posté par:

Sophie Dupont

beBee Recruiter

Description

Date Limite Candidature : lundi 6 mars 2023

**Informations générales**:
Référence : UMR5242-MICAVE-012
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : LYON 07
Date de publication : lundi 13 février 2023
Nom du responsable scientifique : Michalis Averof et Mathilde Paris
Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 1 octobre 2023
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : 3043 € brut mensuel (plus allocation familiale, le cas échéant)

**Description du sujet de thèse**:
Une bourse de doctorat de 3 ans en biologie régénérative est proposée à l'Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon (IGFL) en France. Cette bourse est financée par le réseau doctoral Marie Curie REGENERATE-IT.

1) Découvrir dans quelle mesure les mêmes instructions génétiques sont utilisées pour générer une jambe au cours du développement embryonnaire et de la régénération, en identifiant les éléments cis-régulateurs des gènes de modelage clés et en comparant leur activité au cours du développement et de la régénération chez des animaux transgéniques.
2) Reconstruire les réseaux de régulation génique (GRN) putatifs du développement et de régénération de la jambe, en se basant sur des analyses bioinformatiques de données RNAseq et de profilage chromatinien de cellules uniques, en validant les nœuds sélectionnés et en comparant leurs rôles dans le développement et la régénération avec des expériences in vivo.
3) Identifier les progéniteurs de différents types cellulaires au cours de la régénération, sur la base de la reconstruction de trajectoires cellulaires à l'aide de données snRNseq, de la mise en place d'outils de marquage de type Brainbow et du suivi des cellules, notamment par microscopie en direct.

**Contexte de travail**:
L'étudiant.e. sera inscrit.e comme doctorant.e à l'École Normale Supérieure de Lyon, et sera co-supervisé.e par Michalis Averof et Mathilde Paris.

**Contraintes et risques**:
**Informations complémentaires**:
L'étudiant.e recevra par le laboratoire hôte une formation en génétique moléculaire et du développement, en microscopie et en génomique, dans le cadre du projet de recherche, ainsi qu'une formation en biologie régénérative dans le cadre du réseau doctoral REGENERATE-IT. La formation sera adaptée aux besoins de l'étudiant.e et du projet sélectionné (voir ci-dessus).

La bourse comprend des périodes de détachement pour formation/recherche dans les laboratoires d'autres partenaires de REGENERATE-IT et la participation aux réunions annuelles et aux formations organisées par le réseau, afin de tirer pleinement parti du large éventail d'expertises disponibles dans le réseau. L'étudiant.e aura l'occasion de développer des compétences en matière de présentation orale, de rédaction et d'autres compétences transférables, notamment au travers d'activités de vulgarisation auprès du grand public.