Bioinformaticien (H/F) - Lyon, France - KELLY OCG

KELLY OCG

Entreprise vérifiée

Lyon, France

il y a 3 semaines

Posté par:

Sophie Dupont

beBee Recruiter

Description

**KELLY OCG**, est une société de prestation de services intellectuels dédiée aux industries de santé.
Notre savoir-faire, le domaine des **Life Sciences**.

Nos collaborateurs experts scientifiques, accompagnent nos clients dans la réalisation de leurs projets, tout au long du développement d'un médicament ou produit de santé et de son évaluation.
Ensemble, nous contribuons à la réussite des prestations dans le cadre d'un travail collaboratif, et adaptons les prestations aux besoins spécifiques de nos clients.

Notre client est un laboratoire pharmaceutique international qui s'engage pour le progrès thérapeutique au bénéfice des patients, en lien avec les professionnels de santé. Sa croissance repose sur la recherche constante d'innovation dans de multiples aires thérapeutiques.

Nous recrutons un **Bioinformaticien H/F**, pour le département des Sciences Analytiques de notre client,

Dans le cadre de vos fonctions, vous participerez à la définition des stratégies d'analyse, la mise en place des outils et pipelines, la réalisation des analyses, la rédaction des instructions et des résultats pour:

- L'identification des micro-organismes utilisés dans les procédés de fabrication des vaccins à partir de données de whole genome sequencing
- L'agrégation de pipelines d'analyses existants pour la détermination de l'identité et le séquençage de plasmide à partir des données de whole genome sequencing
- L'agrégation de pipelines d'analyses existants pour la détection de séquence exogènes à l'échantillon (métagénomique)

**Et vos principales responsabilités seront**:

- Participation à la stratégie d'analyse,
- Mettre en place les pipelines d'analyses bio-informatiques sous Snakemake pour l'analyse des données issues de plateforme HTS (Illumina et Oxford Nanopore), pour une analyse simplifiée par les techniciens de laboratoire via notre infrastructure dans le cloud,
- Réaliser le criblage et l'évaluation des différents outils d'analyse à partir de jeux de données de séquençage existants,
- Rédiger les instructions d'utilisation des pipelines d'analyse,
- Assurer la formation des équipes de techniciens de laboratoire,
- Participer à la qualification des méthodes analytiques sur la partie bio-informatique (rédaction de protocole, réalisation des analyses, rédaction de rapport)
- Assurer le testing des lots techniques produits sur la période.

**Profil**:

- Vous êtes issus d'un Master en Bio-informatique**.**:

- Environnement Techniques et Applications Obligatoires:
Principaux outils dédiés à l'analyse de données de HTS short-read et long-read (QC, Trimming, De novo Assembling, Mapping, Variant calling, etc ).
Analyse prédictive (Annotation de génome, analyse structurale computationnelle, matrice de substitution, etc ).
Programmation dans un langage de scripting (Snakemake, Python, R, bash,).

Type d'emploi : Temps plein, CDD
Durée du contrat : 6 mois

Salaire : 1 614,38€ à 3 687,78€ par mois

Avantages:

- Prise en charge du transport quotidien
- RTT
- Titre-restaurant

Programmation:

- Du lundi au vendredi
- Travail en journée

Expérience:

- analyse de données de HTS?: 2 ans (Exigé)
- analyse prédictive ?: 2 ans (Exigé)

Lieu du poste : Télétravail hybride Marcy-l'Étoile)