Rôle Du Système de Régulation de La - Nantes, France - Laboratoire US2B - Nantes Université

Description

**Rôle du système de régulation de la transcription PhoBR dans l'interaction entre Vibrio cholerae et Uronema marinum**:

- Réf
- **ABG-117562**
- Stage master 2 / Ingénieur- Durée 6 mois- Salaire net mensuel /10/2023- Laboratoire US2B - Nantes Université- Lieu de travail- Nantes Pays de la Loire France- Champs scientifiques- Biologie
- Mots clés- remodelage lipidique, interaction hôte-bactérie, trafic intracellulaire, vibrio-
- 05/11/2023**Établissement recruteur**:
**Site web**:
L'unité en Sciences Biologiques et Biotechnologies (US2B) est un laboratoire académique développant des recherches fondamentales en biochimie et biologie.Par des approches in-vitro, in-vivo et in-silico, le laboratoire conduit des recherches centrées sur les thèmes de la régulation des fonctions des protéines et la biorégulation des activités biologiques. En particulier, les recherches viseront à répondre à des problématiques fondamentales et appliquées dans les domaines de la biologie structurale (compréhension de la relation séquence-structure-fonction), du génie moléculaire, des glycosciences, du contrôle de l'intégrité des génomes, des régulations épigénétiques de l'expression des génomes (de la chromatine à la traduction), des interactions biologiques (microalgue-bactéries, plante-bactéries, plante-plante etc) et de l'adaptation biologique à l'environnement.

**Description**:
Vibrio cholerae est une bactérie Gram négative, libre que l'on retrouve dans divers habitats, tel que les environnements marins, d'eau douce ou intestinaux. Certaines souches de V. cholerae peuvent également être pathogènes pour l'homme et provoquer le choléra, une maladie diarrhéique aiguë et déshydratante. Une des voies de contamination régulièrement mises en avant est la consommation de fruits de mer ou de poissons crus contaminés par V. cholerae. Parmi les différents environnements colonisés par V. cholerae, l'agent responsable du choléra peut se retrouver dans des milieux aquatiques pauvres en Phosphate inorganique (Pi), tels que les environnements marins ou les compartiments phagocytaires. Sa capacité à prospérer dans ces environnements pauvres en nutriments est déterminée par une régulation étroite de l'expression de ses gènes. Pour survivre à la limitation en Pi, de nombreuses bactéries régulent les gènes impliqués dans le transport et le métabolisme des composés phosphatés, appartenant au régulon Pho, en utilisant le système de régulation de la transcription à deux composants PhoBR. Parmi les nombreuses stratégies contrôlées par PhoBR, les bactéries peuvent réduire leur demande cellulaire en Pi en remplaçant les phospholipides membranaires par des lipides de substitution ne contenant pas de Pi entrainant une modification de 50% des lipides membranaires.

En milieu environnemental, y compris en milieu marin, les bactéries subissent une pression constante de la part de prédateurs bactérivores tels que les protozoaires. L'association étroite entre les bactéries et les protozoaires hétérotrophiques et leur longue histoire co-évolutive a donné́ lieu à une série d'adaptations bactériennes assurant la survie et la coexistence. V. cholerae utilise plusieurs mécanismes de protection pour éviter la digestion par les protozoaires, ce qui entraine souvent la production de compartiments hyper-concentrés et hyper-infectieux de V. cholerae qui sont transférés le long de la chaîne trophique. Dans un premier temps afin d'être phagocyté, V. cholerae doit être reconnu par son prédateur (capture), puis celui-ci doit résister à l'environnement agressif du compartiment phagocytaire, qui comprend à la fois une limitation en nutriment (Pi) et une réduction drastique du pH (digestion), avant de pouvoir éventuellement croître au sein de cet environnement (multiplication).

Le changement radical dans la composition des membranes induit par le remodelage lipidique et par le système PhoBR pourrait avoir des conséquences imprévues sur d'autres aspects de la physiologie bactérienne, notamment sur la composition des autres composants membranaires (LPS, protéine) ou sur la manière dont ces organismes interagissent avec leur environnement biotique. L'objectif de ce stage est d'identifier si l'activation du système PhoBR joue un rôle dans les mécanismes de reconnaissance et de résistance de V. cholerae face à Uronema marinum, un protiste prédateur marin appartenant au groupe des ciliés.

**Profil**:
**Prise de fonction**:

- 08/01/2024