Thèse en Bioinformatique - Montpellier, France - CNRS

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Entreprise vérifiée

Montpellier, France

il y a 2 semaines

Posté par:

Sophie Dupont

beBee Recruiter

Description

Cette offre est disponible dans les langues suivantes:

- Français
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Date Limite Candidature : lundi 6 mai 2024

**Informations générales**:
**Intitulé de l'offre **:Thèse en bioinformatique (H/F)**
Référence : UMR5535-SARADE-049
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : lundi 15 avril 2024
Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 1 octobre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : La rémunération est d'un minimum de 2135,00 € mensuel
Section(s) CN : Modélisation mathématique, informatique et physique pour les sciences du vivant

**Description du sujet de thèse**:
"Caractérisation automatique des éléments régulateurs du génome humain par intégration multimodale de données '-omiques'"
Caractériser la grammaire génomique qui régule l'expression des gènes, est un domaine de recherche intense. Plusieurs approches d'apprentissage machine ont montré qu'il était possible de prédire de nombreuses régulations génomiques sur la base de la séquence ADN seule. Ces modèles sont par essence appris sur les signaux expérimentaux majoritaires qui, en raison des stratégies de mapping, sont souvent localisés dans les régions codantes et/ou bien annotées du génome. Pourtant, de nombreuses régions non
- codantes ont des fonctions régulatrices et les mécanismes biologiques sous-jacents sont très divers. Pour capturer cette diversité, de nouveaux modèles doivent être développés avec pour objectifs (i) d'identifier automatiquement les régions sujettes aux mêmes mécanismes biologiques (construction supervisée de classes) et (ii) d'apprendre les caractéristiques (motifs et k-mers) de ces régions. Ces modèles permettront également de mieux interpréter les variations génétiques observées dans des régions mal ou non annotées.

**Contexte de travail**:
**Contraintes et risques**:

- Variabilité possible des horaires de travail (soir et/ou week-end)