Chef de Laboratoire - Paris e, France - Fondation Jean Dausset CEPH

Description

** du laboratoire de Bio-informatique (H/F)**

**Contrat à durée indéterminée - CDI**

Dans ce contexte, la Fondation Jean Dausset - CEPH recrute **un.e du laboratoire de Bio-informatique expérimenté.e (CDI)**.

**Missions**
- Développer et mener des projets de recherche en bio-informatique
- Conduire les analyses bio-informatiques et statistiques des projets de recherche en génétique et génomique humaines de la Fondation.
- Encadrer et animer une équipe de 2-3 personnes composés d'ingénieur et chercheurs bio-informaticiens.

**Activités**
- Être l'instigateur de nouveaux programmes et projets de recherche en bio-informatique, génétique et/ou génomique (réponse aux AAPs) avec des approches nouvelles et originales (IA,) et exploitant les données génomiques de la Fondation.
- Encadrer l'équipe bio-informatique en étant le référent scientifique et technique, incluant l'encadrement d'étudiants, doctorants et post-doctorants.
- Concevoir, implémenter et optimiser des solutions (nouveaux outils et pipelines) pour l'intégration et l'exploitation des données de différents types d'expériences et plateforme de séquençage (WGS, WES, TGS, RNA-seq, puces à ADN, séquençage de 2ème et 3ème générations).
- Conduire les analyses bio-informatiques pour les différents projets de recherche de la Fondation incluant les contrôles qualité sur des données génomiques, l'interprétation et la présentation des résultats.
- Mettre à disposition des autres équipes de la Fondation son expertise et ses conseils pour l'analyse de leurs données et le montage de projets de recherche. Les accompagner et les former dans l'utilisation des outils statistiques en fonction de leurs besoins.
- Veille technologique dans le domaine du traitement de données issues de l'(épi)génomique et la transcriptomique.

**Formation**
- Titulaire d'un diplôme d'Ingénieur ou d'une Thèse de Sciences, vous devrez justifier d'une formation en informatique ou bio-informatique, suivie d'une expérience d'au moins 10 ans en analyse de données dans le domaine de la génomique.
- Bonnes connaissances en génétique et génomique humaines et méthodes de séquençage.

**Compétences Requises**
- Capacité d'animation et d'encadrement d'une équipe de bio-informatique.
- Fortes compétences organisationnelles, rédactionnelles et analytiques, rigueur, respect, responsabilité.
- Aptitude à comprendre des problématiques scientifiques dans le domaine biomédical.
- Goût pour le travail en équipe, capacité à se mettre au service des autres équipes.
- Capacités à communiquer au sein d'équipes pluridisciplinaires et bon relationnel.
- Excellent niveau d'anglais et de français, aisance à l'oral et à l'écrit.
- Motivation, dynamisme et curiosité.
- Compétences techniques:

- Bonne connaissance du domaine du génie logiciel et de la bio-informatique
- Bonne connaissance d'Unix, Bash, Python, clusters de calcul (Slurm, LSF)
- Bonne connaissance des outils de traitement de données NGS (WGS, WES, TGS RNA-seq) de préférence en santé humaine (maladies rares, cancer)

**Salaire**
- Selon qualification & expérience (de 40 à 50 K€ brut annuel).

Candidature (lettre de motivation et CV avec liste de publications) à transmettre à l'attention de:

- Jean-François Deleuze et Eric Charretier à (**rbifjd-** ).

Type d'emploi : Temps plein, CDI
Statut : Cadre

Salaire : 40 000,00€ à 50 000,00€ par an

Avantages:

- Prise en charge du transport quotidien
- RTT
- Titre-restaurant

Programmation:

- Du lundi au vendredi

Lieu du poste : En présentiel