M/F Postdoctoral Fellow in proteomics of silks - Paris, France - CNRS

Description

Informations générales

Intitulé de l'offre : H/F Postdoctorat en protéomique des soies
Référence : UMR8170-ANNVAL-007
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : PARIS
Date de publication : vendredi 24 mai 2024
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 novembre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Entre 2993 € à 4389 € bruts mensuels selon l'expérience.
Niveau d'études souhaité : Niveau 8 - (Doctorat)
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
Section(s) CN : Biologie moléculaire et structurale, biochimie

Missions

Dans le cadre du projet WILDSILKS financé par l'ANR (CNRS/EHESS/MNHN), nous recherchons un chercheur / une chercheuse dynamique et enthousiaste pour un poste de 12 mois à compter du 1er novembre 2024. Le projet vise à explorer les techniques de production, les usages et les circulations de soies sauvages issues de pièces de musées et de cultures matérielles contemporaines. Il rassemble une équipe interdisciplinaire s'appuyant sur l'histoire, l'anthropologie sociale, la biologie, les sciences physiques et biochimiques, ainsi que les sciences de la conservation.

Activités

Activités:
- Le ou la candidate retenue effectuera des analyses protéomiques 1/ sur des fils de soie et des cocons frais afin de construire un référentiel sur les espèces sauvages n'ayant pas encore été étudiées en protéomique ; 2/ sur des tissus anciens et historiques afin de procéder à l'identification à l'espèce.
- Sur la base de la littérature publiée, le ou la candidate adaptera et développera des méthodologies d'extraction et d'identification de protéines à partir de diverses soies sauvages à la fois à partir de matériel biologique de référence récent et de tissus modernes et anciens. L'identification des espèces biologiques d'origine des fils de soie est en effet particulièrement difficile pour les tissus archéologiques et/ou endommagés. Les techniques classiques d'identification morphologique (microscopie optique ou MEB) ne permettent pas toujours de déterminer de façon certaine s'il s'agit de soie sauvage avec l'œil d'un expert et difficilement de remonter jusqu'à l'espèce, notamment dans les espèces moins connues utilisées pour les tissus historiques. C'est pourquoi l'approche par identification de protéines en appliquant des stratégies protéomiques utilisant la chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse en tandem (LC-MS/MS) sera mise en œuvre pour ces identifications taxonomiques.
- Dans un premier temps, le ou la postdoctorante travaillera sur des cocons réunis par l'ANR et des tissus de référence d'espèces connues (teints ou non). Après caractérisation optique et par spectroscopies vibrationnelles (FTIR et Raman) à la recherche d'éventuels marqueurs de genre ou d'espèce, des tests de solubilisation pour analyse protéomique seront réalisés (vérification de la présence effective et du poids moléculaire des protéines de l'extrait) suivi de l'analyse protéomique elle-même.
- Dans un second temps, la méthode développée sera appliquée à des micro-échantillons historiques et archéologiques, collectés par le projet ANR (de l'Antiquité au XXIe siècle, d'origines géographiques diverses) et dont le caractère "sauvage" a déjà été criblé par FTIR. Selon l'état de conservation de ces artefacts, le ou la candidate pourra être amené.e à adapter la méthodologie d'analyse à la fragilité des échantillons étudiés.
- L'analyse complète des données sera effectuée grâce au moteur de recherche de base de données Mascot d'abord mais aussi aux logiciels PEAKS et ByonicTM.

Le ou la candidate retenue devra :
- Adapter les méthodologies expérimentales existantes en protéomique pour les fils de soie anciens
- Utiliser des équipements scientifiques spécialisés tels que des instruments LC-MS/MS
- Collaborer avec des collègues dans les domaines de l'anthropologie, de l'archéologie, de l'histoire et de la biochimie dans le cadre du projet ANR
- Rédiger et préparer des rapports scientifiques et des articles de revues et présenter occasionnellement des papiers dans des conférence et des posters.

Compétences

Doctorat en chimie, biochimie, science archéologique ou textile ou dans un domaine connexe
- Expérience avec des échantillons textiles historiques et patrimoniaux
- Capacité à gérer la recherche universitaire et à générer des idées nouvelles et intéressantes, bonnes compétences en communication.
- Une expérience directe dans le domaine de la protéomique et de solides compétences en laboratoire et en exploration de données (en particulier en utilisant les logiciels ByonicTM ou PEAKS) ainsi qu'une expérience dans l'application de la protéomique aux échantillons du patrimoine culturel sont souhaitables.
- Français non obligatoire, environnement de travail ouvert aux anglophones
- IMPORTANT : la lettre de motivation devra précisément expliquer comment le ou la candidate espère s'insérer au sein du projet ANR – les candidatures non ciblées (CV et/ou lettre de motivation standardisés pour un poste en chimie analytique par exemple) ne seront pas considérées.

Contexte de travail

Le ou la postdoctorante travaillera sous la direction directe du coordinateur de l'équipe « biochimie » de l'ANR WILDSILKS et du coordinateur général du projet. Le ou la chercheuse sera hébergée au Centre de Recherche sur la Conservation (CRC, UAR 3234, https:///fr ) du Muséum National d'Histoire Naturelle (MNHN, 57 rue Cuvier, 75005 Paris, France). Il ou elle utilisera les équipements analytiques de la plateforme analytique du Musée (/en/the-museum-analytical-platform ). Il ou elle travaillera également en étroite relation avec les autres membres de l'ANR WILDSILKS.

Contraintes et risques

La préparation des échantillons impliquera l'utilisation de solutions acides et de solvants organiques, qui se fera sous hotte.