Bourse Doctorale Marie Curie - Lyon e, France - CNRS

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Entreprise vérifiée

Lyon e, France

il y a 2 semaines

Posté par:

Sophie Dupont

beBee Recruiter

Description

Cette offre est disponible dans les langues suivantes:

- Français
- Anglais

Date Limite Candidature : jeudi 15 février 2024

**Informations générales**:
**Intitulé de l'offre **:Bourse doctorale Marie Curie (H/F): Cartographie des divers types cellulaires dans la patte des arthropodes**
Référence : UMR5242-MICAVE-014
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : LYON 07
Date de publication : jeudi 25 janvier 2024
Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 1 octobre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Entre 3038 et 3469 € brut mensuel
Section(s) CN : Biologie cellulaire, développement, évolution-développement, reproduction

**Description du sujet de thèse**:
Une bourse doctorale de 3 ans est disponible à l'Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon (IGFL) en France, pour caractériser la microanatomie, les profils moléculaires et les fonctions de divers types de cellules - y compris des types de cellules inconnus - présents dans la patte des arthropodes. La bourse est financée par le réseau doctoral Marie Curie ZooCell.
Les pattes des arthropodes sont des organes polyvalents, contenant divers types de cellules impliquées dans la sensation (neurones, cellules gliales), le mouvement (muscles, tendons, articulations), la protection et l'immunité (épiderme, cellules du sang), ainsi que de nombreux types de cellules dont les fonctions sont inconnues. L'étudiant.e recruté.e produira un atlas cellulaire, intégrant les profils moléculaires de plus de 15 types de cellules distinctes qui composent la jambe de l'arthropode avec des données d'ultrastructure, et identifiera les fonctions et les relations évolutives de ces diverses cellules.
L'étudiant.e accomplira cette tâche chez le crustacé Parhyale hawaiensis, que nous avons déjà commencé à explorer à l'aide de la microscopie électronique à balayage et de la transcriptomique. Les pattes de Parhyale contiennent plus de 15 types de cellules identifiées par snRNAseq, correspondant à des cellules épidermiques, neuronales, musculaires et sanguines, ainsi qu'à plusieurs types de cellules encore inconnues ou non caractérisées. L'étudiant.e étudiera la jambe de Parhyale à une résolution subcellulaire à l'aide d'un MEB à faisceaux multiples, afin d'identifier les types de cellules sur la base de leur ultrastructure, et associera chacun d'entre eux aux signatures transcriptionnelles correspondantes en utilisant des approches corrélatives de microscopie optique et électronique. La microanatomie et les profils transcriptionnels permettront d'explorer l'identité de ces cellules, leurs fonctions et leurs relations avec les cellules d'autres animaux. Des outils génétiques tels que l'ablation cellulaire médiée par la transgénèse ou l'inactivation de gènes par CRISPR (déjà établis à Parhyale) seront utilisés pour tester les fonctions de ces cellules et le rôle des régulateurs clés qui les définissent.

**Contexte de travail**:
L'étudiant.e fera également partie de la communauté plus large des étudiants du réseau doctoral ZooCell, qui comprend 12 laboratoires à travers l'Europe. Les étudiant.e participera aux activités de formation organisées par le réseau, y compris des cours pratiques et des visites de recherche/formation dans un laboratoire partenaire.
L'étudiant.e. sera inscrit.e comme doctorant.e à l'École Normale Supérieure de Lyon, et sera co-supervisé.e par Michalis Averof et Mathilde Paris.

**Informations complémentaires**:
L'étudiant.e recevra une formation en biologie moléculaire, génétique et microscopie dans le cadre du projet de recherche, ainsi qu'une formation en microscopie électronique et en analyse d'images dans le cadre du réseau doctoral ZooCell. La formation sera adaptée aux besoins de l'étudiant.e.
La bourse comprend des périodes de détachement pour formation/recherche dans les laboratoires d'autres partenaires de ZooCell et la participation aux réunions annuelles et aux formations organisées par le réseau, afin de tirer pleinement parti du large éventail d'expertises disponibles dans le réseau. L'étudiant.e recruté.e aura l'occasion de développer des compétences en matière de présentation orale, de rédaction et d'autres compétences transférables, notamment au travers d'activités de vulgarisation auprès du grand public.