Doctorant (F/H) Shape Analysis of - Rennes, France - Inria

Inria
Inria
Entreprise vérifiée
Rennes, France

il y a 2 semaines

Sophie Dupont

Posté par:

Sophie Dupont

beBee Recruiter
Description
**Type de contrat **:CDD

**Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent

**Fonction **:Doctorant

**A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**:
Le centre Inria de l'Université de Rennes est un des neuf centres d'Inria et compte plus d'une trentaine d'équipes de recherche. Le centre Inria est un acteur majeur et reconnu dans le domaine des sciences numériques. Il est au cœur d'un riche écosystème de R&D et d'innovation : PME fortement innovantes, grands groupes industriels, pôles de compétitivité, acteurs de la recherche et de l'enseignement supérieur, laboratoires d'excellence, institut de recherche technologique

**Contexte et atouts du poste**:
Magnetic resonance imaging (MRI) and in particular diffusion MRI (dMRI) provide detailed information about the macroscopic organisation of brain white matter (WM) fiber bundles (see Figure), with a method called fiber tractography. Complementary to the geometry of fibers, dMRI is also sensitive to the microscopic tissue structure and its alteration with pathology. The joint analysis of white matter fascicles and their associated microstructure organisation requires the development of specific mathematical representations.

**Mission confiée**:
The main objective of this thesis will be the development of mathematical models of microstructure-augmented fascicle (MAF), which convey both the macro-structural information provided by tractography and the microstructural information provided by the diffusion models along the WM fascicles. In the context of the PASTRAMI (**Pa**tient-specific **s**tatistics for micros**tr**ucture-**a**ugmented connecto**mi**cs) collaborative project (funded by the PRC program, agence nationale de la recherche, , these representations will be used to derive patient-specific biomarkers of functional recovery in patients suffering from severe traumatic brain injury.

**Principales activités**:
We will develop upon a shape analysis frameworks such as the LDDMM (Large Diffeomorphic Metric Mapping) framework that relies on Riemannian geometry and is well adapted to the study of anatomical structures, to construct the models for the representation of fiber bundles (which can be defined as 1-dimensional curves or 2-dimentional surfaces in R3) and their associated microstructure. In continuation, we will also analyse the brain connectome, which represents the network of connected gray matter regions in the brain. We will build upon methods developed for the analysis of graphs with complex data.

**Compétences**:
**Avantages**:

- Prise en charge partielle des frais de transport en commun sur le trajet domicile-travail ou
FMD.
- Restauration subventionnée
- Prise en charge partielle des frais de mutuelle
- Possibilité de télétravail (à hauteur de 90 jours annuels) et d'aménagement du temps de travail

**Rémunération**:
Salaire mensuel brut de 2 100 € les deux premières années et 2 190€ la troisième année.

**Informations générales**:

- **Thème/Domaine**: Neurosciences et médecine numériques
Biologie et santé, Sciences de la vie et de la terre (BAP A)
- **Ville**: Rennes
- **Centre Inria**: Centre Inria de l'Université de Rennes
- **Date de prise de fonction souhaitée**:
- **Durée de contrat**: 3 ans
- **Date limite pour postuler**:

**Consignes pour postuler**:
Merci de déposer en ligne CV, lettre de motivation et éventuelles recommandations

**Sécurité défense**:
Ce poste est susceptible d'être affecté dans une zone à régime restrictif (ZRR), telle que définie dans le décret n° relatif à la protection du potentiel scientifique et technique de la nation (PPST). L'autorisation d'accès à une zone est délivrée par le chef d'établissement, après avis ministériel favorable, tel que défini dans l'arrêté du 03 juillet 2012, relatif à la PPST. Un avis ministériel défavorable pour un poste affecté dans une ZRR aurait pour conséquence l'annulation du recrutement.

**Politique de recrutement**:
Dans le cadre de sa politique diversité, tous les postes Inria sont accessibles aux personnes en situation de handicap.

**Contacts**:

- **Équipe Inria**: EMPENN
- **Directeur de thèse**:
**L'essentiel pour réussir**:
Vous pouvez donner là, un portrait à "gros traits" du (de la) collaborateur(trice) attendu(e) : ce que vous voyez comme nécessaire et suffisant et qui peut associer:

- goûts et appétences,
- domaine d'excellence,
- éléments de personnalité ou de caractère,
- savoir et savoir faire transversaux...

Cette rubrique permet de compléter et alléger (réduire) la liste plus formelle des compétences:

- "Se sentir à l'aise dans un environnement de dynamique scientifique, aimer apprendre et écouter sont des qualités essentielles pour réussir cette mission."
- " Passionné(e) par l'innovation, avec une expertise dans le développement Ruby on Rail et une grande capacité de conviction. Une thèse dans