Mécamismes Moléculaires Des Régulations D'arnm - Montpellier, France - Université de Montpellier

Université de Montpellier

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Montpellier, France

il y a 3 semaines

Posté par:

Sophie Dupont

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Description

**Mécamismes moléculaires des régulations d'ARNm dans les granules à ARN // Molecular mechanisms of mRNA regulation in RNA granules**:

- Réf **ABG-122639**
**ADUM-55825**
- Sujet de Thèse- 11/04/2024- Contrat doctoral- Université de Montpellier- Lieu de travail- Montpellier CEDEX 5 - France- Intitulé du sujet- Mécamismes moléculaires des régulations d'ARNm dans les granules à ARN // Molecular mechanisms of mRNA regulation in RNA granules- Mots clés- Condensats biomoléculaires, Contrôle traductionnel, Génétique, Granules à ARN, Imagerie en molécule unique, Microscopie
- Biomolecular condensates, RNA granules, mRNA regulation, Single-molecule imaging, Microscopy, Genetics**Description du sujet**:

- Les condensats biomoléculaires qui compartimentent protéines et acides nucléiques sont reconnus comme des acteurs essentiels de l'organisation de la biochimie cellulaire. Leur assemblage dépend du principe de séparation de phase qui s'opère lorsqu'un seuil de concentration de leurs composants est atteint. Malgré les progrès rapides dans la compréhension des propriétés biophysiques des condensats biomoléculaires, leurs fonctions biologiques sont peu explorées. Le projet de thèse utilisera les granules germinaux de l'embryon de drosophile, un modèle remarquable de condensats à ARN, et visera à analyser les mécanismes moléculaires des régulations d'ARNm dans ces granules. Deux types de régulation coexistent dans les granules germinaux: le stockage d'ARNm réprimés, et l'activation traductionnelle. L'étudiant utilisera une technique novatrice de triage de particules par FACS pour isoler les granules germinaux à partir d'embryons de drosophile. Des approches de RNA-seq et de spectrométrie de masse seront ensuite utilisées pour identifier les composants des granules germinaux, en particulier les régulateurs impliqués dans la répression et l'activation traductionnelle. Ces régulateurs seront étudiés par l'approche génétique et leur rôle dans la formation et l'architecture des granules sera analysé par microscopie à super résolution et microscopie en molécule unique. Le projet sera réalisé en étroite collaboration avec l'équipe d'A. Hubstenberger à l'iBV de Nice.
- Méthodes: Génétique moléculaire de la drosophile; Tri de particules; Imagerie/Microscopie; Biologie moléculaire des ARN/génomique: RNA-seq; small RNA-seq; protéomique
Biomolecular condensates have recently emerged as key players in the organization of cellular biochemistry by compartmentalizing proteins and nucleic acids. Condensate assembly occurs via the principle of phase separation, leading to the demixing of components upon reaching a concentration threshold. Despite the universal conservation of biomolecular condensates and the fast progress in understanding their biophysical properties, their biological functions remain largely unexplored. The PhD project will use germ granules in the Drosophila embryo, an outstanding model of RNA condensates, and analyze the molecular mechanisms of mRNA regulation within these granules. Two types of regulation coexist in these granules: the storage of repressed mRNAs and translational activation. The project will build on an innovative FACS method for particle sorting to purify germ granules from Drosophila embryos. Then RNA-seq and mass spectrometry will be used to identify all components of germ granules, in particular regulators involved in translational repression and activation. These regulators will be studied through the genetic approach and their role in the formation and architecture of germ granules will be addressed using super-resolution microscopy and single-molecule imaging approaches. The project will be performed in collaboration with A. Hubstenberger at iBV in Nice.
- Methods and approaches: Drosophila molecular genetics; Imaging/Microscopy; Proteomics; RNA molecular biology/Genomics: RNA-seq; small RNA-seq.
Début de la thèse : 01/10/2024**Nature du financement**:

- Contrat doctoral**Précisions sur le financement**:

- Concours pour un contrat doctoral**Présentation établissement et labo d'accueil**:

- Université de Montpellier**Etablissement délivrant le doctorat**:

- Université de Montpellier**Ecole doctorale**:

- 168 Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé13/05/2024