Ecologie Et Rôle Des Microorganismes Associés Aux - Gif-sur-Yvette, France - Université Paris-Saclay GS Santé et médicaments

Description

**Ecologie et rôle des microorganismes associés aux termites // Ecology, evolution and role of microorganisms associated with termites**:

- Réf
- **ABG-111420**

**ADUM-45905**
- Sujet de Thèse- 24/02/2023- Université Paris-Saclay GS Santé et médicaments- Lieu de travail- Gif-sur-Yvette - France- Intitulé du sujet- Ecologie et rôle des microorganismes associés aux termites // Ecology, evolution and role of microorganisms associated with termites- Mots clés- Métabolomique, Holobionte, Occurence, Termites, Antimicrobiens, Génomique
- Metabolomic, Holobiont, Occurence, Termites, Antimicrobial, Genomic**Description du sujet**:

- Les insectes sont associés à une très grande variété de formes de vie microscopiques. En effet, ces insectes sociaux vivent dans des espaces confinés, avec une forte densité de population, des interactions fréquentes, une homogénéité génétique et un environnement homéostatique. Tous ces facteurs devraient favoriser la transmission d'agents infectieux, en particulier des champignons ou bactéries pathogènes. Cependant, il semble que cela n'altère pas la viabilité des colonies de termites.
- L'étude des termites comme holobionte a été jusqu'à présent peu explorées ce qui ouvre un potentiel important d'identification de composés impliqués dans les interactions biotiques.
- Lors d'une investigation menée précédemment par l'ICSN sur la recherche de composés antimicrobiens, un travail d'isolement de souches associées à des termites a permis d'obtenir 6 souches fongiques du genre Pseudallescheria. Nous avons démontré que ces champignons produisent entre autres des composés antifongiques, et laisse à penser la possibilité d'autres occurrences dans les mutualismes termite/microorganisme. Ainsi, ce projet vise dans un premier temps à caractériser les communautés de microorganismes symbiotiques des termites de Guyane française. Dans un second temps l'étude du métabolome de l'holobionte « colonie de termite/microorganisme » sera effectuée afin d'identifier de possibles occurrences de composés produits pouvant avoir un rôle putatif dans la protection de l'ensemble des termitières étudiées. In fine les métabolites des souches occurentes identifiées comme protégeant les colonies contre les microbes de l'environnement seront testés sur des souches pathogènes humaines à des fins de valorisations.
Insects are associated with a very wide variety of microscopic life forms. Indeed, these social insects live in confined spaces, with a high population density, frequent interactions, genetic homogeneity and a homeostatic environment. All these factors should favor the transmission of infectious agents, especially pathogenic fungi or bacteria. However, it seems that this does not alter the viability of termite colonies.
- The study of termites as holobionts has been little explored so far which opens up a significant potential for identifying compounds involved in biotic interactions.
- In a previous investigation conducted by ICSN on the search for antimicrobial compounds, an isolation of termite-associated strains yielded 6 fungal strains of the genus Pseudallescheria. We have demonstrated that these fungi produce, among others, antifungal compounds, and suggest the possibility of other occurrences in termite/microorganism mutualisms. Thus, this project aims first to characterize the communities of symbiotic microorganisms of termites in French Guiana. Secondly, the metabolome of the termite colony/microorganism holobiont will be studied in order to identify possible occurrences of compounds produced that could have a putative role in the protection of the termite nests studied. In fine, the metabolites of the occurring strains identified as protecting the colonies against environmental microbes will be tested on human pathogens for valorization purposes.
Début de la thèse : 01/10/2023-
**Nature du financement**:
**Précisions sur le financement**:

- Contrats ED : Programme blanc GS-HeaDS**Présentation établissement et labo d'accueil**:

- Université Paris-Saclay GS Santé et médicaments**Etablissement délivrant le doctorat**:

- Université Paris-Saclay GS Santé et médicaments**Ecole doctorale**:

- 569 Innovation thérapeutique : du fondamental à l'appliqué- Master 2 de chimie, biotechnologie, pharmacologie, écologie chimique, pharmacien Compétences - Chimie analytique : Extraction de substances naturelles, préparation d'échantillons pour des analyses chimiques, analyses par spectrométrie de masse et chromatographie, maîtrise des techniques de préparation et d'analyse d'échantillons biologiques. Identification par RMN 1D & 2D. - Informatique : maitrise d'outils d'analyse statistique, réseaux moléculaires, Python. - Esprit d'équipe, autonome et rigoureux. - métabolomique: utilisation des outils de déréplication et d'annotation. -