Expression Et Localisation D'entérotoxines de - Rennes, France - INRAE STLO et ANSES SBCL

Description

**Expression et localisation d'entérotoxines de Staphylococcus aureus nouvellement décrites lors d'une croissance en produit laitier**:

- Réf
- **ABG-114453**
- Sujet de Thèse- 16/05/2023- Autre financement public- INRAE STLO et ANSES SBCL- Lieu de travail- Rennes - Bretagne - France- Intitulé du sujet- Expression et localisation d'entérotoxines de Staphylococcus aureus nouvellement décrites lors d'une croissance en produit laitier- Champs scientifiques- Agronomie, agroalimentaire
- Biologie
- Ecologie, environnement
- Mots clés- Microbiologie, biologie moléculaire, bioanalyse, omics**Description du sujet**:
Les toxi-infections alimentaires collectives (TIAC) à staphylocoques sont causées par l'ingestion d'aliments contaminés par des entérotoxines staphylococciques (SE), produites par certaines souches de staphylocoques à coagulase positive. Pendant la dernière décennie, les TIAC dues aux toxines bactériennes ont augmenté de 10% à 20%, dont la moitié était liée aux SE. Détecter des échantillons contaminés en amont s'avère donc crucial. Différentes méthodes d'analyses existent pour évaluer la contamination d'un échantillon alimentaire. Or, dans 70 à 90% des cas, le Laboratoire National de Reference (ANSES) ne peut pas détecter la présence de SE bien que les échantillons contiennent des staphylocoques produisant des SE. Dans ce contexte, l'objectif du projet de thèse est d'étudier l'expression, la régulation et la localisation des SE peu documentées dans le fromage afin d'expliquer leur non détection dans des échantillons fortement contaminés en Staphylocoques à Coagulase Positive porteur des gènes SE.

Le projet nécessitera le développement d'approches in silico (génomique, bioanalyse, modélisation moléculaire), de physiologie bactérienne, de RNASeq, de biologie moléculaire (qPCR) et de biochimie (ELISA, protéomique, Western blot).

**Prise de fonction**:

- 01/11/2023**Nature du financement**:

- Autre financement public**Précisions sur le financement**:

- INRAE / ANSES**Présentation établissement et labo d'accueil**:

- INRAE STLO et ANSES SBCLLe doctorat sera réalisé à l'INRAE (35) et sur de courtes périodes à l'ANSES (94).

**STLO (Rennes)**: Le laboratoire Science et Technologie du Lait et de l'Oeuf (INRAE, Institut Agro) compte 140 personnes. Le groupe de recherche dans lequel vous travaillerez est composé de 25 permanents (scientifiques, ingénieurs et techniciens) et de 10 à 15 vacataires (CDD, master, PhD, post-doc). Le groupe possède une expertise reconnue en fermentation alimentaire, microbiologie moléculaire, biochimie du lait, biologie cellulaire, protéome et volatilome, transcriptome, microscopie et en génomique (diversité, fonction) des bactéries laitières.

**SBCL (Maison-Alfort) **:L'unité Staphylococcus, Bacillus et Clostridium (SBCL) étudie ces trois bactéries productrices de toxines, sur lesquelles elle mène des activités de référence, de recherche et de surveillance. Son expertise permet de nourrir l'évaluation des risques, de contribuer à l'évolution du système de surveillance des bactéries productrices de toxines dans les denrées alimentaires et d'aider les directions générales des ministères de tutelle de l'Agence dans leurs prises de décision.

**Site web**:
**Intitulé du doctorat**:

- Doctorat de Microbiologie, virologie et parasitologie**Pays d'obtention du doctorat**:

- France**Etablissement délivrant le doctorat**:

- Agrocampus Ouest**Ecole doctorale**:

- Écologie, Géosciences, Agronomie, Alimentation (EGAAL)Formation : Master 2 de Microbiologie avec une appétence pour la microbiologie alimentaire et/ou génétique bactérienne.

Connaissances en biologie moléculaire, bioanalyse et omics.- 02/06/2023