Bioinformaticien -recherche Sur Le Cancer (H/F) - Paris, France - Institut Curie
Description
Date de clôture- 31/07/2024- Lieu(x) de travail- Paris- Secteur- Centre de Recherche- CDDL'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche et de la lutte contre le cancer. Il est constitué d'un hôpital et d'un Centre de recherche de plus de 1000 collaborateurs avec une forte représentativité internationale.L'objectif du Centre de recherche de l'institut Curie est de développer la recherche fondamentale et d'utiliser les connaissances produites pour améliorer le diagnostic, le pronostic, la thérapeutique des cancers dans le cadre du continuum entre la recherche fondamentale et l'innovation au service du patient.
**Laboratoires d'accueil**
Equipe Stress et Cancer - Directeur : Fatima Mechta-Grigoriou
Equipe Computational Biology - Directeur : Hervé Isambert
**Description du poste**
**Projet financé par la Commission européenne**, dans le cadre du programme Horizon Europe, Mission Cancer 2023.
**Titre**: Évaluation du rôle du microbiote intratumoral dans les réponses thérapeutiques à l'aide de tumeurs sur puce dérivées de patients
**Acronyme**: ARTURO
Ce projet interdisciplinaire et international (France, Italie, Portugal), coordonné par Maria Carla Parrini, sera développé en collaboration entre l'Institut Curie, l'Institut Pierre-Gilles de Gennes pour la microfluidique, l'hôpital Bichat à Paris, l'Universidade Catolica Portuguesa à Porto, l'Université de TorVergata à Rome et l'Université Humanitas à Milan.
**Nos récentes publications pertinentes**
1. Assessing personalized responses to anti-PD-1 treatment using patient-derived lung tumor-on-chip
Veith et al, **Cell Rep Med** 2024, preprint. doi:
2. CausalXtract: a flexible pipeline to extract causal effects from live-cell time-lapse imaging data
Simon et al, **eLife** 2024, preprint.
3. Deciphering the spatial landscape and plasticity of immunosuppressive fibroblasts in breast cancer
Croizer et al, **Nat Commun** 2024 Apr 1;15(1):2806.
**Formation et compétences**
Nous recherchons un-e bioinformaticien-ne au niveau pré-doctoral ou post-doctoral avec:
- un intérêt marqué pour l'analyse de données biologiques hétérogènes complexes
- une expérience préalable dans l'analyse de données de séquençage (RNA-Seq de bulk, single-cell et/ou spatial transcriptomic)
- une compétence dans le traitement de données -omiques à nombre de dimensions élevé
- maîtrise de langages de haut niveau tels que Python ou R et des bonnes pratiques de codage
- des compétences en analyse d'images (ce serait un plus).
- Le développement d'un projet de doctorat sur le sujet est une possibilité ouverte.
**Aptitudes requises**
Autonomie, capacité organisationnelle, esprit d'équipe, adaptabilité à la multidisciplinarité, anglais courant.
**_ Toutes nos opportunités sont ouvertes à des personnes en situation de handicap._**
**Informations sur le contrat**
**Type de contrat** : contrat à durée déterminée
**Date de démarrage**: immédiat
**Durée du contrat** : 3 ans
**Temps de travail** : temps complet
**Rémunération**: selon les grilles en vigueur
**Avantages**_ : _restauration collective, prise en charge du titre de transport annuel à 70%, mutuelle d'entreprise
**Localisation du poste** : Institut Curie, 23 rue d'Ulm, 75005 Paris
Pour postuler, merci d'envoyer CV, lettre de motivation et 2 références
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