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CNRS Lyon, France CDDInformations générales · Intitulé de l'offre : H/F Ingénieur d'études en bioinformatique, analyse de données génomiques · Référence : UMR5667-JULPRA-009 · Nombre de Postes : 1 · Lieu de travail : LYON 07 · Date de publication : mercredi 15 mai 2024 · Type de contrat : CDD Techn ...
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Décoder les règles de la régulation du programme de réplication de l'ADN
il y a 2 semaines
CNRS Lyon, France CDDInformations générales · Intitulé de l'offre : Décoder les règles de la régulation du programme de réplication de l'ADN (H/F) · Référence : UMR5672-BENAUD-007 · Nombre de Postes : 1 · Lieu de travail : LYON 07 · Date de publication : dimanche 19 mai 2024 · Type de contrat : CDD ...
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Ingénieur de recherche
il y a 2 semaines
CNRS Lyon, France CDDInformations générales · Intitulé de l'offre : Ingénieur de recherche (H/F) en biologie moléculaire, transcriptomique, microbiologie · Référence : UMR5239-FABDUV-003 · Nombre de Postes : 1 · Lieu de travail : LYON 07 · Date de publication : mercredi 22 mai 2024 · Type de contra ...
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Post-doc H/F étude du microbiote des plantes non-mycorhiziennes
il y a 3 semaines
CNRS Villeurbanne, France CDDInformations générales · Intitulé de l'offre : Post-doc H/F étude du microbiote des plantes non-mycorhiziennes - M/F · Référence : UMR5557-BEABIG-024 · Nombre de Postes : 1 · Lieu de travail : VILLEURBANNE · Date de publication : mardi 14 mai 2024 · Type de contrat : CDD Scient ...
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Ingénieur-e biologiste H/F
il y a 3 semaines
CNRS Villeurbanne, France NOEMIInformations générales · Ouverte aux titulaires et CDI CNRS & fonction publique · Intitulé de l'offre : Ingénieur-e biologiste H/F · Référence : UMR5557-MOBINT-Z55005 · Lieu de travail : VILLEURBANNE · Institut : INEE - Institut d'écologie et environnement · Date de publicatio ...
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Bioinformaticien Pour Le Développement
il y a 2 semaines
CNRS Lyon, FranceDate Limite Candidature : lundi 4 septembre 2023 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Bioinformaticien pour le développement d'environnements d'analyse de données génomiques et métagénomiques (H/F)** · Référence : UAR3601-GUYPER-002 · Nombre de Postes : 1 · Li ...
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Décoder Les Règles de La Régulation Du Programme
il y a 2 semaines
CNRS Lyon e, FranceCette offre est disponible dans les langues suivantes: · - Français · - Anglais · Date Limite Candidature : dimanche 9 juin 2024 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Décoder les règles de la régulation du programme de réplication de l'ADN (H/F)** · Référence : ...
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Chercheur Post Doctorant
il y a 3 semaines
CNRS Lyon e, FranceDate Limite Candidature : vendredi 17 février 2023 · **Informations générales**: · Référence : UMR5239-ISASER-021 · Nombre de Postes : 1 · Lieu de travail : LYON 07 · Date de publication : vendredi 27 janvier 2023 · Type de contrat : CDD Scientifique · Durée du contrat : 24 mois ...
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Cdi - Data Mangement Leader - (F/H)
il y a 2 semaines
bioMérieux sa Lyon, FranceDescriptif du poste · **Quelles seront vos responsabilités ?**Vous aurez le rôle de manager (environ 60 % de votre temps). Dans ce but: · - Vous serez responsable des processus de Data Management et dans ce but, de la bonne exécution des essais cliniques selon les réglementations ...
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CNRS LYON ER ARRONDISSEMENT, FranceAfin de déterminer comment les mutations aléatoires contribuent à l'évolution de la régulation d'expression des gènes, l'équipe a entrepris la mise au point d'une approche de transcriptomique à haut débit (microcolony RNA-seq) permettant de quantifier les niveaux d'ARNm de millie ...
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Data Manager
il y a 3 semaines
Hospices Civils de Lyon - HCL Lyon, France**Détails de l'offre**: · **POSTE PROPOSÉ** · Data Manager H/F - GCS Auragen · **DESCRIPTIF** · L'ÉTABLISSEMENT: · Les Hospices Civils de Lyon, ce sont 13 hôpitaux publics, tous animés par une triple mission : le soin, la recherche et l'enseignement. Nous formons ensemble une com ...
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Post-doctorat (H/F)
il y a 2 semaines
CNRS Villeurbanne, FranceCette offre est disponible dans les langues suivantes: · - Français · - Anglais · Date Limite Candidature : vendredi 1 décembre 2023 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Post-doctorat (H/F) sur la recherche d'associations génotype-phénotype à l'échelle phylogé ...
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Data Manager
il y a 3 semaines
Hospice Civil de Lyon Lyon e, France**À propos de nous**: · Les Hospices Civils de Lyon, ce sont 13 hôpitaux publics, tous animés par une triple mission : le soin, la recherche et l'enseignement. Nous formons ensemble une communauté de femmes et hommes, soignants et non soignants, partageant une seule et même vocat ...
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Chercheuse / Chercheur en Neurosciences Du Cancer
il y a 2 semaines
CNRS Lyon e, FranceCette offre est disponible dans les langues suivantes: · - Français · - Anglais · Date Limite Candidature : jeudi 22 février 2024 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Chercheuse / Chercheur en Neurosciences du Cancer (H/F)** · Référence : UMR5286-CELDEL-002 · ...
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Chercheuse / Chercheur en Biologie Du Cancer (H/F)
il y a 2 semaines
CNRS Lyon e, FranceCette offre est disponible dans les langues suivantes: · - Français · - Anglais · Date Limite Candidature : jeudi 10 août 2023 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Chercheuse / Chercheur en biologie du cancer (H/F)** · Référence : UMR5286-CELDEL-001 · Nombre d ...
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Chercheuse / Chercheur en Biologie Du Cancer (H/F)
il y a 1 semaine
CNRS Lyon e, FranceCette offre est disponible dans les langues suivantes: · Date Limite Candidature : jeudi 10 août 2023 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Chercheuse / Chercheur en biologie du cancer (H/F)** · Référence : UMR5286-CELDEL-001 · Nombre de Postes : 1 · Lieu de tr ...
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Post-doc (H/F) étude Du Microbiote Des Plantes
il y a 3 semaines
CNRS Villeurbanne, FranceCette offre est disponible dans les langues suivantes: · - Français · - Anglais · Date Limite Candidature : mercredi 5 juin 2024 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Post-doc H/F étude du microbiote des plantes non-mycorhiziennes - M/F** · Référence : UMR5557- ...
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Postdoctorant en Génomique Environnementale
il y a 3 semaines
CNRS Villeurbanne, FranceCette offre est disponible dans les langues suivantes: · - Français · - Anglais · Date Limite Candidature : lundi 10 avril 2023 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Postdoctorant en génomique environnementale (H/F)** · Référence : UMR5240-AUDMAR-004 · Nombre d ...
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Chercheur en Génomique Des éléments Impliqués
il y a 1 semaine
CNRS Villeurbanne, FranceDate Limite Candidature : lundi 30 janvier 2023 · **Informations générales**: · Référence : UMR5558-NATARB-053 · Nombre de Postes : 1 · Lieu de travail : VILLEURBANNE · Date de publication : lundi 9 janvier 2023 · Type de contrat : CDD Scientifique · Durée du contrat : 15 mois · ...
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Chercheur (H/F)
il y a 1 semaine
CNRS Villeurbanne, FranceCette offre est disponible dans les langues suivantes: · - Français · - Anglais · Date Limite Candidature : jeudi 17 août 2023 · **Informations générales**: · **Intitulé de l'offre **:Chercheur (H/F) post-doctoral sur la résilience du microbiome du sol** · Référence : UMR5557-BEA ...
Ingénieur d'étude en bioinformatique - Lyon, France - CNRS
Description
Informations générales
Intitulé de l'offre : Ingénieur d'étude en bioinformatique (H/F)
Référence : UMR5261-HELPUC-010
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : LYON 08
Date de publication : mardi 7 mai 2024
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 13 mois
Date d'embauche prévue : 1 juillet 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : A partir de 2304 euros bruts mensuel selon expérience.
Niveau d'études souhaité : Niveau 6 - (Bac+3 ou 4)
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
BAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en traitement de données
Missions
Nous recherchons ingé en bioinformatique très motivé.e et cré pour rejoindre l'équipe « Mécanismes fondamentaux et pathophysiologiques impliqués dans les ataxies » à l'Institut Neuromyogène - Laboratoire Physiopathologie et Génétique du Neurone et du Muscle, France. L'agent fera partie d'une équipe de recherche qui se concentre sur les mécanismes impliqués dans les ataxies héréditaires à partir de modèles animaux ou cellulaires. L'agent aura pour mission de développer des méthodes bioinformatiques et statistiques pour analyser, interpréter et intégrer les données omiques à haut débit générées (scRNA-seq, snRNA-seq, spatial transcriptomics, protéomique). L'agent travaillera avec divers membres de l'équipe.
Activités
Analyser et interpréter les résultats omics (scRNA-seq, snRNA-seq, spatial transcriptomics protéomique) de façon autonome
- Présenter ses résultats au reste de l'équipe lors de réunions
- Etre force de proposition dans le contexte de ses missions
Compétences
Obligatoire :
Solides compétences en codage à l'aide de R ou python et connaisance de bases dans les deux languages
Expérience approfondie de l'analyse de données de séquençage transcriptomique
Expérience dans le développement d'algorithmes ou de pipelines de séquençage transcriptomique (alignement, analyse de l'expression différentielle, etc...)
Niveau B2 en anglais requis
Préférable :
Expérience dans l'analyse de données de séquençage de cellules uniques
Expérience en analyse de données obtenues avec la technologie 10X Genomics
Expérience avec git et les lignes de commande basées sur Unix/Linux
Expérience préalable en termes d'extraction d'informations biologiques à partir de données NGS et des principales bases de données bioinformatiques
Expérience préalable de la mise en œuvre de bases de données et/ou de la création de logiciels (. shiny apps)
Connaissances / compétences en analyse biostatistique
Intérêt pour les neurosciences
Contexte de travail
L'activité s'exercera au sein de l'UMR5261, qui se situe à la faculté de Médecine et de Pharmacie Rockefeller. L'Institut NeuroMyoGène est dédié à l'étude de la physiopathologie du muscle et du système nerveux, avec une ouverture vers la recherche clinique et translationnelle. Avec 12 équipes de recherche soit environ 150 personnes, la plus forte concentration en France d'équipes se focalisant sur les maladies neuromusculaires, les objectifs de notre unité sont d'élucider des aspects fondamentaux de la biologie du muscle et du système nerveux, depuis le développement embryonnaire jusqu'au vieillissement. Nos équipes de recherche déploient des méthodes d'approche multidisciplinaire allant du gène aux fonctions physiologiques.