Doctorant (H/F) - Strasbourg, France - CNRS

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Strasbourg, France

il y a 3 semaines

Sophie Dupont

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Sophie Dupont

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Description
Cette offre est disponible dans les langues suivantes:

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Date Limite Candidature : vendredi 15 décembre 2023

**Informations générales**:
**Intitulé de l'offre **:Doctorant (H/F) : Caractérisation multi-omique du rôle des mécanismes de protection contre l'autoxicité pour l'évolution du métabolisme des plantes**
Référence : UPR2357-EMMGAQ-002
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : STRASBOURG
Date de publication : vendredi 24 novembre 2023
Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 1 février 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : 2135,00 € mensuel
Section(s) CN : Biologie intégrative des organismes photosynthétiques et des microorganismes associés

**Description du sujet de thèse**:
De nombreux métabolites spécialisés de plantes (MSPs) agissent comme défenses chimiques contre les bioagresseurs. L'interruption génétique d'étapes de leur biosynthèse peut conduire à des symptômes d'autotoxicité et de retard de développement, indiquant que la mise en place de mécanismes biochimiques de protection est une pression de sélection clé dans l'évolution des MSPs. Comprendre comment ces mécanismes de protection contre une autotoxicité potentielle évoluent de concert avec l'apparition de nouvelles fonctions défensives reste peu exploré. Le projet de recherche EVOMET (ANR-DFG) s'appuie sur nos découvertes sur la biosynthèse et l'autotoxicité potentielle pour la plante des glycosides diterpèniques1,2,3 ainsi que sur d'autres travaux sur les glycoalcaloïdes stéroïdiens. Les objectifs du projet sont (i) d'établir, pour huit espèces de Solanacées, des atlas combinant métabolomique et transcriptomique afin d'effectuer une caractérisation exhaustive de la diversité biochimique pour ces deux voies métaboliques; (ii) de retracer leur évolution moléculaire et caractériser les gènes sous sélection positive ; et (iii), via des approches fonctionnelles, de comprendre les mécanismes, encore inconnus, permettant de mitiger l'autoxicité potentielle pour la plante de ces MSPs tout en maximisant leurs fonctions de défense contre les bioagresseurs. La démarche intégrative du projet EVOMET s'inscrit dans le contexte d'une collaboration franco-allemande financée par l'ANR et la DFG. Le doctorant (H/F) sera principalement en charge des analyses métabolomiques et de biochimie fonctionnelle et bénéficiera d'une synergie forte et d'échanges réguliers avec le groupe du Prof. Dr. Shuqing Xu de l'Université de Mainz, expert en génomique évolutive.

**Contexte de travail**:
Le doctorant (H/F) sera affilié à l'institut de Biologie Moléculaire des Plantes (IBMP) et à l'école doctorale 414 « Santé et Sciences de la Vie » de Strasbourg, France. L'IBMP est le plus large institut du CNRS dédié à la biologie végétale, situé sur le campus de l'Esplanade de l'Université de Strasbourg, près du centre historique de la ville. L'IBMP propose une recherche d'excellence visant, à travers l'étude des processus fondamentaux de la vie des plantes, à répondre aux enjeux sociétaux en matière de nutrition, de santé et d'environnement. L'IBMP héberge 16 équipes et des plateformes technologiques de pointe en imagerie, métabolomique, analyse de l'expression des gènes et production végétale. La thèse sera réalisée dans le laboratoire « Évolution et Diversité du Métabolisme des Plantes » dirigée par Emmanuel Gaquerel (IBMP) et implique des échanges réguliers et visites, dans le cadre du projet ANR-DFG EVOMET, avec le laboratoire partenaire du Prof. Dr. Shuqing Xu de l'Université de Mainz.

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