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Orsay

    Post-doctorant (H/F) pour le développement de la microscopie de fluorescence en molécules uniques combinée à des approches de deep learning - Orsay, France - CNRS

    CNRS
    CNRS Orsay, France

    il y a 6 jours

    Cnrs background
    CDD
    Description

    Informations générales

    Intitulé de l'offre : Post-doctorant (H/F) pour le développement de la microscopie de fluorescence en molécules uniques combinée à des approches de deep learning
    Référence : UMR8214-VERSAR-008
    Nombre de Postes : 1
    Lieu de travail : ORSAY
    Date de publication : samedi 23 mars 2024
    Type de contrat : CDD Scientifique
    Durée du contrat : 12 mois
    Date d'embauche prévue : 1 juin 2024
    Quotité de travail : Temps complet
    Rémunération : Salaire mensuel en fonction de l'expérience, compris entre 2992,93 € et 4204,22 € brut
    Niveau d'études souhaité : Niveau 8 - (Doctorat)
    Expérience souhaitée : Indifférent
    Section(s) CN : Physique des atomes, molécules et plasmas. Optique et lasers

    Missions

    La personne recrutée fera partie de l'équipe NANOBIO et participera au développement de nouvelles approches de microscopie super-résolue, alliant le développement optique et les applications biologiques. Dans le cadre de ce poste, il s'agira de développer un microscope permettant d'observer les cellules à différentes échelles au-delà de la limite de diffraction, en appliquant soit une illumination structurée (SIM) afin de gagner un facteur 2 en résolution, soit en combinant l'illumination structurée avec la localisation des molécules uniques (technique ModLoc brevetée par l'équipe), dans une nouvelle configuration optique. Ces développements optiques se feront en parallèle de l'utilisation de nouvelles approches d'analyse de type deep learning, développées en collaboration avec l'équipe de R. Henriques. Au sein de ce consortium européen, les applications biologiques se feront en collaboration avec l'institut Curie, et une partie des développements instrumentaux/logiciels se feront avec la société Abbelight.
    Le poste pourra être prolongé d'une nouvelle période de 12 mois.

    Activités

    La personne contribuera à différents aspects en fonction de son expérience :
    - mise en place des éléments optiques pour la réalisation de ce nouveau dispositif instrumental
    - utilisation/développement de nouvelles modalités d'analyse basées sur le deep learning
    - tests et validation du nouveau dispositif expérimental
    - programmation pilotage/simulation
    - caractérisation sur différents échantillons
    - rédaction d'articles
    - participation à des conférences

    Compétences

    optique
    - microscopie
    - programmation en python
    - connaissances en imagerie de molécule unique (acquisition et traitement)
    - connaissances en photophysique
    - connaissances en culture cellulaire

    Contexte de travail

    Ce travail se fera au sein de l'ISMO (Unité Mixte CNRS / Université Paris-Saclay) dans le cadre d'un projet européen EIC PAthfinder impliquant 4 autres laboratoires et une entreprise (Abbelight). Le laboratoire dispose d'une salle de culture sur site et de différents microscopes pour la localisation de molécule unique.

    Contraintes et risques

    faisceau laser
    - culture cellulaire



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